Apikotomija je oralno hirurški zahvat kojim se uklanja vrh korijena zuba (apex), najčešće zbog hroničnih upala ili fraktura u području vrha korijena (granuloma ili ciste). Apikotomija se provodi u lokalnoj anesteziji, što znači da je tretman bezbolan..

Zahvat kreće tako da se zubno meso zareže i podigne kako bi se došlo do korijena zuba. Zahvatom se uklanja vrh korijena zuba zajedno s upalnim procesom, a nakon toga se korijen kanala zuba puni različitim smjesama i materijalima koji su za to predviđeni. Ovisno o individualnom slučaju pacijenta, zub se endodontski može tretirati (čišćenje i širenje kanala zuba, te njegovo punjenje) prije samog zahvata ili za vrijeme zahvata. Na kraju se vraća gingivalni režanj i ušiva se rana. Apikotomija je danas sve češći zahvat jer omogućuje pacijentima očuvanje zuba koji se ne mogu izliječiti endodontskom terapijom i koji bi se inače morali izvaditi. Smatra se malim hirurškim zahvatom, a traje od 30 do 60 minuta, ovisno o kojoj regiji i zubu se radi. Zahvati na prednjim zubima su u pravilu kraći, dok su na donjim kutnjacima duži.

Apikotomija je vrlo uspješna metoda liječenja, ali budući da je hirurški zahvat, ne obavlja se u svim ordinacijama